威斯特法伦马的起源，与为服务于北莱茵及威斯特法伦地区而在1826年成立的瓦伦多夫国家种马场紧密相连。为提高德语使用地区马匹繁育的水平，当时的国王弗雷德里克·威廉姆一世于1713年建立了普鲁士种马场管理局，瓦伦多夫国家种马场是在管理局之下建立的。政府拥有的种马场，通常叫作“国家种马场”，负责购买种公马以满足周边地区配种的需求。国有种公马的配种费较低，以期帮助育马者将重挽马改良为高质量的骑乘马。

第一批在瓦伦多夫种马场配种的种公马来自东普鲁士，和当时的特雷克纳马十分相似。这些马适合朝臣及骑兵驾驭，是带有纯血马血统的骑乘马。随着莱茵和威悉河流域人口的增长，在农业上要求马匹性能转向中等重型并具有全能用途马的趋势增加。高贵的东普鲁士种公马被来自奥尔登堡和东弗里西亚的重型温血马所取代。

到了20世纪之初，在该地区重型温血马被更加适合的莱茵河冷血马取代。莱茵河冷血马在拉重犁和大炮方面性能更佳，同时它们主要在维克拉特国有种马场附近繁育，瓦伦多夫种马场的温血马逐渐被冷血马取代。随着自动化和农业技术的变革，重型马的发展使其自己走上了绝路。由于重型马不再流行，维克拉特种马场于1957年解散。温血马的种群补充进了汉诺威附近的母马和种公马，由此形成了现代威斯特法伦马的基础。简而言之，现代的威斯特法伦马主要是以汉诺威马为育种的基础，引入一些纯血马和特雷克纳马的血液进行杂交育成的温血马。

威斯特法伦马品种协会始建于1888年，1904年品种登记会建立，目前该登记会为德国温血马第二大登记会，仅次于汉诺威马登记会。

联邦骑术学校于1968年被纳入国家种马场旗下。学校对获得国家签发牌照的骑手和教练进行培训和考核，其亦是德国奥林匹克马术委员会的总部所在。瓦伦多夫（种马场）同时主持着每年的种公马性能测试。

威斯特法伦马和德国其他温血马在繁育的标准上有着一致性，尤其在基因物质方面与周边的莱茵兰德马及汉诺威马有着很大程度上的融合。所有德国骑乘马的繁育标准均强调马匹具有吸引力、身线修长、服从而勇敢、开朗、步态有弹性、具备适应各类骑乘的脾气、性格及被驾驭能力。威斯特法伦马的血统不如纯血马般精纯，也不似冷血马般粗糙。（马术杂志）